L'État de l'Oregon et les autorités fédérales ont confirmé mercredi que la grippe aviaire H5N1 avait été découverte chez un porc vivant dans le comté de Crook – la première infection porcine de ce type signalée dans l'épidémie actuelle.
La souche du virus de la grippe aviaire chez le porc est légèrement différente de celle qui sévit chez les vaches laitières en Californie et dans d'autres États, connue sous le nom de B3.13. Au lieu de cela, il s’appelle D1 et provient d’oiseaux sauvages qui ont probablement emprunté la voie migratoire du Pacifique.
Les deux souches sont H5N1 ; ils ont simplement suivi des trajectoires évolutives légèrement différentes, ce qui se reflète dans leur séquence génétique.
Selon les scientifiques, la découverte du virus de la grippe chez un porc, quelle que soit la souche, est une évolution préoccupante.
« Il s'agit d'un événement majeur que tout le monde redoutait », a déclaré Rick Bright, virologue et ancien chef de l'Autorité américaine de recherche et de développement biomédical avancé.
Les porcs sont considérés par les responsables de la santé comme des bols efficaces pour mélanger le virus de la grippe : ils sont sensibles aux virus de la grippe aviaire et humaine et peuvent potentiellement fournir à différents virus l'occasion d'échanger du matériel génétique et devenir une menace plus grande pour les humains.
« Jusqu'à présent, les experts et les commentateurs ont minimisé l'épidémie, affirmant : « mais elle n'a pas encore touché les porcs ». Eh bien, cela semble être le cas maintenant, et juste à temps pour que l’autre ingrédient essentiel puisse créer un virus pandémique… les virus de la grippe humaine saisonnière », a déclaré Bright.
Il a déclaré qu'il était essentiel que les autorités fédérales agissent rapidement et de manière transparente.
« Nous ne pouvons pas nous permettre de continuer à jouer à un jeu attentiste », a-t-il déclaré. « Nous savons tous à quelle vitesse ce virus peut apparaître et se propager. Nous devons immédiatement le retirer de ces fermes, accroître toute surveillance et commencer à planifier des actions pour une réponse plus large. … Nous ne pouvons pas nous permettre d'attendre et de voir… encore une fois. Nous devons agir maintenant.
John Korslund, un vétérinaire épidémiologiste à la retraite du Département américain de l'Agriculture, s'est montré un peu plus circonspect.
le porc infecté était l'un des cinq porcs vivant dans une petite ferme. Tous les porcs ont été testés et euthanasiés. Les résultats pour deux des autres porcs étaient négatifs, tandis que les autres sont en attente. En outre, les autorités fédérales affirment que seuls de « faibles niveaux de virus » ont été détectés dans les échantillons.
Korslund a déclaré que cela suggère que le virus pourrait nécessiter un contact étroit, comme l'eau partagée, pour se déplacer.
« Je serai plus inquiet s'il voyage par aérosol jusqu'à un bâtiment de confinement », a-t-il déclaré, ajoutant qu'un porc servant de récipient de mélange n'est « pas aussi probable dans les troupeaux de basse-cour – un risque plus important dans les troupeaux commerciaux où la grippe est plus endémique. »
Le , qui est situé dans une zone juste à l'est de Bend, n'est pas une exploitation commerciale, selon le ministère américain de l'Agriculture. Ses animaux n'étaient pas destinés à la production alimentaire commerciale.
En conséquence, les responsables fédéraux affirment qu'il n'y a aucune inquiétude quant à la sécurité de l'approvisionnement en porc du pays. Ils notent également que la cuisson adéquate des aliments et la pasteurisation des produits laitiers inactivent le virus.
La ferme où vivaient les porcs est la même que celle où 70 « oiseaux de basse-cour » infectés ont été testés et euthanasiés la semaine dernière après la détection du H5N1. La ferme est en quarantaine et le département de l'agriculture de l'État surveille la zone.
Ces oiseaux portaient la version D1, ce qui suggère qu’ils n’ont pas été infectés par des vaches laitières. Au lieu de cela, il est probable qu’ils l’aient obtenu auprès d’oiseaux sauvages.
« Sur la base des résultats de diagnostics récents, il est évident que les oiseaux aquatiques migrateurs déplacent ce nouveau génotype « D » le long de la voie de migration du Pacifique », a déclaré Bryan Richards, coordinateur des maladies émergentes au National Wildlife Health Center de l'US Geological Survey.
Au cours des deux dernières semaines, plusieurs éclosions ont eu lieu dans des troupeaux commerciaux et de basse-cour en Colombie-Britannique, dans l'État de Washington et en Oregon. La vétérinaire de l'État de Californie, Rebecca Jones, a déclaré mardi au Times qu'un petit troupeau de basse-cour à Santa Rosa avait également été infecté par la souche D1.
Ce troupeau n'est pas répertorié sur le site Web de l'USDA.
En outre, deux élevages commerciaux de poulets dans le comté de Kings en Californie et un élevage de basse-cour dans le comté de Tulare ont été signalés infectés mardi. Encore une fois, les souches particulières du H5N1 chez ces oiseaux n’ont pas été identifiées.
Les scientifiques sont frustrés de constater que le séquençage génétique n’a pas été disponible pour certaines de ces dernières épidémies.
« Le gros problème pour moi », à propos du cochon, a déclaré Korslund, c'est « le refus de nommer le clade ». Était-ce le clade laitier ou autre chose ? Nous avons également une autre épidémie de volailles dans l'Oregon avec des troupeaux laitiers dans les environs dont personne n'a reconnu l'existence. [regarding] le sous-clade. S’il s’agit de B3.13, ils doivent tester les troupeaux laitiers.
Une étude de 2017 sur l'agriculture dans le comté de Crook a indiqué qu'il y avait 47 399 vaches et veaux dans le comté.
il y a eu 393 troupeaux infectés par le H5N1 depuis mars dans 14 États, sans compter l'Oregon. Près de la moitié d’entre eux – 193 – se trouvent en Californie.
Lorsqu'on lui a demandé si une nouvelle souche de H5N1 dans le mélange allait compliquer la situation, Maurice Pitesky, professeur agrégé spécialisé dans la recherche sur la santé des volailles et l'épidémiologie de la sécurité alimentaire à l'UC Davis, a répondu oui.
« C'est la troisième année de migration, où le virus semble redescendre » via les oiseaux qui ont passé l'été dans l'Arctique et ont échangé des virus, a-t-il déclaré. « Si cela continue, il sera beaucoup plus difficile d’arrêter. »
Il a déclaré qu'il y a quelques années, il avait travaillé sur un modèle informatique capable de prédire où le virus apparaîtrait lorsque les oiseaux migreraient vers le sud. Il a dit que cela fonctionnait, et maintenant les gens lui demandent d’en développer un autre.
«Je ne peux pas», dit-il. « C'est trop complexe maintenant. Maintenant, c'est dans les eaux usées urbaines, c'est chez les mammifères sauvages. C'est chez les vaches laitières. C'est chez les oiseaux chanteurs. C'est chez la sauvagine et les oiseaux de rivage. C'est chez les mammifères marins… Nous n'avons jamais rien eu de tel auparavant au niveau des espèces, au niveau géographique et au niveau de la sécurité alimentaire. Ouah. »