Séquençage du génome du crapaud ibérique, clé dans l’étude du changement global

Un groupe dirigé par Station biologique de Doñana (EBD-CSIC) a séquencé en haute résolution le génome du crapaud ibérique (Pelobates cultripes), une espèce d’amphibien clé pour étudier comment les organismes réagissent au changement global. Les travaux sur cette espèce, qui habite principalement sur la presqu’île ibérique et en certains endroits du sud-ouest de la Francea été réalisé en collaboration avec le Centre national d’analyse génomique (CNAG-CRG) et le Centre national de calcul intensif (BSC-CNS), a rapporté l’EBD-CSIC dans un communiqué.

Les amphibiens, le groupe de vertébrés le plus menacé de la planète, jouent un rôle fondamental dans les écosystèmes et servent de lien entre les systèmes aquatiques et l’environnement terrestre qui les entoure. Cependant, ils ont généralement des génomes volumineux et complexes, de sorte que le nombre de génomes connus au niveau de la résolution chromosomique est très faible : le génome de seulement 12 espèces d’amphibiens ont été décrites -selon le National Center for Biotechnology Information des États-Unis- ce qui représente moins de 0,5 % de tous les amphibiens.

Cette espèce est capable d’accélérer son développement jusqu’à 30% lorsqu’elle perçoit le risque d’assèchement du milieu aquatique

Cela contraste avec d’autres groupes comme les oiseaux, dont le génome de plus de 500 espèces a été décrit, soit environ 5 % du total, ou les mammifères, qui comptent plus de 460 espèces avec leurs génomes séquencés, ce qui représente environ 7 % du total. le total. « Les amphibiens sont un groupe d’étude parfait pour mener des études génomiques », a expliqué Iván Gómez-Mestre, chercheur à l’EBD-CSIC. « Ils représentent souvent des lignées très anciennes qui ont réussi à occuper la plupart des régions du monde et se sont tellement diversifiés qu’ils ont évolué vers un grand nombre de modes de reproduction différents et ont beaucoup varié dans la taille et la structure de leurs génomes », ajoute-t-il.

Le crapaud ibérique, protagoniste de ce travail, est également une sorte d’étude intéressante pour comprendre comment les organismes peuvent réagir au changement global. Sa capacité à ajuster son comportement, morphologie Oui physiologie aux changements de votre environnement est énorme.

Par exemple, le même groupe de recherche qui vient de séquencer son génome a découvert que cette espèce est capable d’accélérer son développement jusqu’à 30% lorsqu’il perçoit le risque d’assèchement du milieu aquatique dans lequel il se développe.

« Le séquençage du génome de cet amphibien permettra de comprendre la structure génétique des populations naturelles, de comprendre comment les variations environnementales induisent des changements dans les niveaux d’expression de ses gènes, ou comment la taille est liée à la complexité des génomes », a conclu Christophe Liedtkechercheur EBD-CSIC.

Un groupe dirigé par Station biologique de Doñana (EBD-CSIC) a séquencé en haute résolution le génome du crapaud ibérique (Pelobates cultripes), une espèce d’amphibien clé pour étudier comment les organismes réagissent au changement global. Les travaux sur cette espèce, qui habite principalement sur la presqu’île ibérique et en certains endroits du sud-ouest de la Francea été réalisé en collaboration avec le Centre national d’analyse génomique (CNAG-CRG) et le Centre national de calcul intensif (BSC-CNS), a rapporté l’EBD-CSIC dans un communiqué.